Thomas Krüger ist seit 2000 Präsident der Bundeszentrale für politischen Bildung.
Seit 1995 ist er Präsident des Externer Link: Deutschen Kinderhilfswerkes. Außerdem ist er zweiter stellvertretender Vorsitzender der Externer Link: Kommission für Jugendmedienschutz und Mitglied des Kuratoriums für den Externer Link: Geschichtswettbewerb des Bundespräsidenten.
1991 bis 1994 war er Senator für Jugend und Familie in Berlin und von 1994 bis 1998 Mitglied des Deutschen Bundestages.