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Zu den wichtigsten wissenschaftlichen Methoden gehört der Vergleich, die Komparatistik. Was bei anderen Gegenständen gang und gäbe ist, stößt bei der Untersuchung von NS- und SED-Diktatur oft auf erhebliche Vorbehalte und auf den Vorwurf der Gleichmacherei. Der Diktaturenvergleich ist dessen ungeachtet notwendig – gerade auch mit Blick auf die politische Kultur und auf die politische Bildung, entsprechend der sogenannten Faulenbachschen Formel, wonach das Leid der stalinistisch Verfolgten durch die Erinnerung an die NS-Opfer ebenso wenig bagatellisiert, wie deren Leiden nicht durch die Würdigung der stalinistisch Verfolgten relativiert werden dürfe.