2012 promovierte sie summa cum laude mit einer Dissertation über die jüdische Religionsphilosophin Margarete Susman. Nach Stationen mit Lehraufträgen an Universitäten bundesweit ist Elisa Klapheck seit 2016 Professorin für Jüdische Studien an der Universität Paderborn, wo sie im Jahr 2021 die Gründung des „Pnina Navè Levinson Seminars für Jüdische Studien“
2004 wurde Elisa Klapheck vom Aleph Rabbinic Program
1997 wurde Elisa Klapheck Pressesprecherin der Jüdischen Gemeinde zu Berlin und Chefredakteurin der Gemeindezeitschrift jüdisches berlin. Als Journalistin schrieb sie für Zeitungen wie die Jüdische Allgemeine Wochenzeitung, den Tagesspiegel, die taz und AVIVA-Berlin und arbeitete für Rundfunk und Fernsehen, darunter die Deutsche Welle. Sie hält Vorträge zu gesellschaftlichen Themen aus jüdischer Sicht und schreibt regelmäßig rabbinische Kommentare in den Medien. Von ihr erschienen sind unter anderem die Bücher „Fräulein Rabbiner Jonas –Kann die Frau das rabbinische Amt bekleiden?“ (1999), „Bertha Pappenheim – Gebete / Prayers“ (2003) und „So bin ich Rabbinerin geworden. Jüdische Herausforderungen hier und jetzt“ (2005), „Wie ich Rabbinerin wurde“ (2012), „Margarete Susman und ihr jüdischer Beitrag zur politischen Philosophie“ (1. Auflage 2014; 2. Aufl. 2021).
Seit 2015 gibt sie die Schriftenreihe „Machloket / Streitschriften“ heraus, in der sie Gegenwartsautor*innen dazu einlädt, eine inhaltliche Auseinandersetzung zur Weiterentwicklung der jüdischen Tradition zu führen. Damit eröffnet sie ein Forum für jüdische Auseinandersetzungen mit gesellschaftlichen Gegenwartsfragen.
Elisa Klapheck ist Mitglied der Allgemeinen Rabbinerkonferenz in Deutschland (ARK) sowie associate member des Rabbinic Board von Liberal Judaism in Großbritannien. Außerdem ist sie Vertrauensdozentin des Ernst Ludwig Ehrlich Studienwerks für jüdische Begabtenförderung (ELES).
Darüber hinaus hat Elisa Klapheck mit Frankfurter Juden/Jüdinnen und Nichtjuden/Nichtjüdinnen „Torat Hakalkala – Verein zur Förderung angewandter jüdischer Wirtschafts- und Sozialethik e.V.“ gegründet.
Elisa Klapheck ist mit dem Rechtsanwalt Abraham de Wolff, dem Sprecher des Arbeitskreises jüdischer Sozialdemokratinnen und Sozialdemokraten, verheiratet.