An der Spitze der Bundeszentrale für politische Bildung steht der Präsident Thomas Krüger. Hauptsitz der Bundeszentrale für politische Bildung ist Bonn. Weitere Dienstsitze befinden sich in Berlin und Gera.
Dem Präsidenten direkt zugeordnet sind die Stabsstelle Kommunikation in Bonn, die Projektgruppe Interdisziplinäre Bildung und Vermittlung „Landshut“ in Bonn, die Arbeitsgruppe „Geschichte der bpb“ in Berlin und die Stabsstelle Innenrevision in Bonn.
Die weitere Aufbauorganisation der Bundeszentrale für politische Bildung gliedert sich in zwei große Bereiche auf: Die Abteilung Z Zentrale Aufgaben und die Fachabteilung. Die Abteilung Z wie auch die Fachabteilung unterstehen dem Präsidenten.
Abteilung Z
Die Abteilung Z Zentrale Aufgaben ist für die Leitung der Verwaltungs-Referate zuständig und bildet das administrative und technisch-organisatorische Rückgrat der Bundeszentrale für politische Bildung. Sie stellt als serviceorientierte Organisationseinheit sicher, dass die personellen, sachlichen und finanziellen Ressourcen für die Aufgabenerfüllung der Fachabteilung zur Verfügung stehen.
Die Abteilung Z Zentrale Aufgaben umfasst 6 Referate:
Referat Z/1: Personal/Organisation, Bonn
Referat Z/2: Haushalt/Vertrieb, Bonn
Referat Z/3: Innerer Dienst, Bonn, Berlin und Gera
Referat Z/4: Justiziariat/Vergabe, Bonn
Referat Z/5: Informationstechnik, Bonn
Referat Z/6: Interne Digitalisierung und Informationssicherheit, Bonn
Fachabteilung
Die Fachabteilung leitet und koordiniert die Grundsätze der Aufgabenwahrnehmung der Fachbereiche.
Der Fachabteilung ist die Projektgruppe Mittel-, Ost- und Südosteuropa in Berlin unmittelbar zugeordnet. Weiterhin umfasst die Fachabteilung 12 Fachbereiche:
Fachbereich A: Grundsatz inklusive Koordinierungsstelle Qualitätssicherung, Bonn
Fachbereich B: Veranstaltungen inklusive Koordinierungsstelle Hauptstadtaufgaben, Bonn und Berlin
Fachbereich C: Zielgruppenspezifische Angebote, Bonn
Fachbereich D: Print, Bonn und Berlin
Fachbereich E: Multimedia, Bonn und Berlin
Fachbereich F: Förderung, Bonn
Fachbereich G: Politische Bildung im ländlichen Raum – Regiestelle Zusammenhalt durch Teilhabe, Berlin
Fachbereich I: Extremismus, Bonn
Fachbereich K: Politische Bildung in Veränderungsprozessen, Gera
Fachbereich L: Politische Bildung und plurale Demokratie, Gera
Fachbereich M: Politische Bildung und Soziale Medien, Gera
Fachbereich X: Service, Gera